中國(guó)構(gòu)建起目前全球最完整海洋微生物基因數(shù)據(jù)庫(kù)
中新社青島9月5日電 (胡耀杰 張孝鵬)“千種海洋生物基因測(cè)序項(xiàng)目”暨全球海洋微生物基因庫(kù)建設(shè)及應(yīng)用成果聯(lián)合發(fā)布會(huì)5日在山東青島舉行。記者從會(huì)上獲悉,華大生命科學(xué)研究院與山東大學(xué)等共同構(gòu)建了目前全球最完整海洋微生物基因數(shù)據(jù)庫(kù)The Global Ocean Microbiome Catalogue(GOMC),并從中發(fā)現(xiàn)大量有應(yīng)用潛力的基因資源。
據(jù)華大生命科學(xué)研究院研究員范廣益介紹,GOMC是已公開海洋基因組數(shù)據(jù)庫(kù)Tara Ocean的3倍、蛋白序列庫(kù)的60倍。目前,GOMC已存儲(chǔ)于中國(guó)的國(guó)家基因庫(kù)生命大數(shù)據(jù)平臺(tái),對(duì)具有應(yīng)用潛力基因資源的相關(guān)研究成果已在學(xué)術(shù)期刊《自然》(Nature)上發(fā)表。
據(jù)介紹,GOMC的構(gòu)建過程中,科研人員對(duì)目前已公開的近240Tb海洋微生物宏基因組數(shù)據(jù)進(jìn)行了重分析。GOMC擁有超4.31萬個(gè)海洋微生物基因組和24.58億個(gè)基因序列,其中有2萬余個(gè)微生物是潛在新發(fā)現(xiàn)物種,近1萬個(gè)微生物是在獨(dú)特生境中首次發(fā)現(xiàn)。
GOMC的研究過程中,科研人員挖掘出1個(gè)具有潛在應(yīng)用價(jià)值的新型Cas9編輯系統(tǒng)(Om1Cas9),將助力中國(guó)在基因編輯工具使用上具有更多獨(dú)立性和選擇;發(fā)現(xiàn)10個(gè)具有顯著抗菌活性及廣譜抗菌效果的新型抗菌肽,該成果的應(yīng)用或?qū)榭股啬退幮噪y題提供新解決方案;發(fā)掘3個(gè)深海來源的高活性新型嗜鹽PET塑料降解酶,或?qū)⒅?shí)現(xiàn)PET塑料的綠色低碳可持續(xù)利用。
據(jù)悉,GOMC是中國(guó)(山東)自貿(mào)試驗(yàn)區(qū)青島片區(qū)與華大生命科學(xué)研究院所屬青島華大基因研究院共同開展的“千種海洋生物基因測(cè)序項(xiàng)目”重要組成部分?!扒ХN海洋生物基因測(cè)序項(xiàng)目”主要內(nèi)容為海洋生物的基因樣本采集、高深度基因組測(cè)序等。(完)
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