2006年1月6日 贈臺大熊貓選定 國臺辦和國家林業(yè)局宣布16號、19號大熊貓“勝出”為贈臺大熊貓，民眾起名“團(tuán)團(tuán)”、“圓圓”
1月20日 2006年兩岸春節(jié)包機(jī) 兩岸各6家航空公司各執(zhí)行36個往返班次，總計72個往返班次。并于2月7日圓滿結(jié)束。
4月中旬 兩岸經(jīng)貿(mào)論壇 14日兩岸經(jīng)貿(mào)論壇在北京舉行，15日論壇閉幕并通過“共同建議”。中臺辦主任陳云林授權(quán)宣布大陸未來進(jìn)一步“促進(jìn)兩岸交流合作、惠及臺灣同胞的15項政策措施”。16日，國家旅游局、公安部和國務(wù)院臺辦等三部門聯(lián)合發(fā)布《大陸居民赴臺灣地區(qū)旅游管理辦法》。
4月16日 二度“胡連會” 中共中央總書記胡錦濤與國民黨榮譽主席連戰(zhàn)舉行二次“胡連會”，胡錦濤就推動兩岸關(guān)系和平發(fā)展提出四點建議。
6月14日 兩岸就客運包機(jī)節(jié)日化和開辦專案包機(jī)達(dá)共識 經(jīng)過海峽兩岸航空運輸交流委員會與臺北市航空運輸商業(yè)同業(yè)會多次協(xié)商，就兩岸客運包機(jī)節(jié)日化和開辦專案包機(jī)的技術(shù)性、業(yè)務(wù)性問題達(dá)成共識。經(jīng)雙方業(yè)務(wù)主管部門認(rèn)可，這個安排自即日起實施。這意味著，兩岸客運包機(jī)將從原來的春節(jié)包機(jī)擴(kuò)大到清明、端午、中秋、春節(jié)四個主要民族傳統(tǒng)節(jié)日期間的兩岸包機(jī)。
7月10日 2006年臺胞青年千人夏令營 “2006年臺胞青年千人夏令營”10日晚在北京開營。來自臺灣島內(nèi)、港澳、海外以及在大陸求學(xué)的1300多位臺灣同學(xué)對于在6天中“有機(jī)會深入交流、認(rèn)識彼此”。此次夏令營以“龍脈相傳，青春中華”為主題，是2004、2005年以來全國臺聯(lián)第三次舉辦兩岸最大規(guī)模青年學(xué)生交流活動。
9月7日 閩臺經(jīng)濟(jì)合作促進(jìn)委員會成立 閩臺經(jīng)濟(jì)合作促進(jìn)委員會7日在廈門成立，福建省委書記盧展工任名譽主任，福建省長黃小晶任主任。聘請何厚鏵、張榮發(fā)、高清愿、郭臺銘等港澳臺以及東南亞知名人士27人擔(dān)任顧問。
9月18日 兩黨臺商權(quán)益保障工作會談 國民黨副主席江丙坤率團(tuán)訪京與中共中央臺辦副主任鄭立中等人舉行第二次兩黨臺商權(quán)益保障工作會談，會后達(dá)成十項共識。
9月27日 臺灣史上最龐大跨海進(jìn)香團(tuán)廈門謁祖 24日，約6000名信眾分別搭乘飛機(jī)、客輪轉(zhuǎn)往廈門謁祖。27日，4300多人的臺灣媽祖聯(lián)誼會大型進(jìn)香團(tuán)與在大陸的2700百余名臺商、臺胞，以及當(dāng)?shù)孛癖�、游客�?萬余人聚集在位于福建莆田湄洲島的媽祖祖廟，舉行大型謁祖進(jìn)香祭祀大典，為有史以來最大規(guī)模的臺胞來大陸交流團(tuán)。
10月16日 兩岸農(nóng)業(yè)合作論壇 16日兩岸農(nóng)業(yè)合作論壇在海南博鰲舉行。全國政協(xié)主席賈慶林就進(jìn)一步推進(jìn)兩岸農(nóng)業(yè)交流與合作提出四點建議。國民黨榮譽黨主席連戰(zhàn)指出，為提升兩岸農(nóng)業(yè)的競爭力，首先要突破“三通”的障礙。論壇并通過共同建議，大陸推出20項深化兩岸農(nóng)業(yè)合作的新措施。
10月30日 海峽兩岸醫(yī)療合作與交流論壇 為期兩天(30、31日)的“2006海峽兩岸醫(yī)療合作與交流論壇”在京舉行，論壇就進(jìn)一步加強和深化海峽兩岸醫(yī)療衛(wèi)生合作與交流，提出七項共同建議。
11月6日 李炷烽提“金廈和平特區(qū)” 金門縣長李炷烽提出，在“一國兩制試驗區(qū)”的架構(gòu)下，成立“金廈和平特區(qū)”。
11月6日 首屆“海峽兩岸法學(xué)論壇” 首屆“海峽兩岸法學(xué)論壇”在京舉行，海峽兩岸150余位法學(xué)界知名學(xué)者、經(jīng)濟(jì)界、企業(yè)界與相關(guān)部門人士在此間出席首屆“海峽兩岸法學(xué)論壇”，討論“兩岸貿(mào)易與投資保護(hù)”。
11月11日 “海峽兩岸客家高峰論壇” 11日，海峽兩岸客家高峰論壇在北京舉行，來自大陸、臺灣、香港的近200名各界客家菁英應(yīng)邀與會。
12月4日 兩岸就大陸居民赴臺游磋商并交換意見 據(jù)海峽兩岸旅游交流協(xié)會相關(guān)負(fù)責(zé)人介紹，近日，海峽兩岸旅游交流協(xié)會與臺灣海峽兩岸觀光旅游協(xié)會，就大陸居民赴臺旅游事宜又進(jìn)行了技術(shù)性磋商，雙方就相互關(guān)心的問題交換了意見。
12月13日 2007年兩岸春節(jié)包機(jī)時間確定 從2007年2月5日開始，包機(jī)運行時間為春節(jié)前后各14天。在此期間，雙方各執(zhí)行48個往返班次，共計96個航次，飛行航點和2006年的春節(jié)包機(jī)一樣，即北京、上海、廣州、廈門和臺北、高雄。
12月13日 海峽兩岸大學(xué)校長論壇 “海峽兩岸大學(xué)校長論壇”在福州舉辦。經(jīng)過一天半的研討，為促進(jìn)兩岸高等教育的創(chuàng)新，與會的兩岸大學(xué)校長達(dá)成了四點共識。
12月15日 兩岸青年論壇 中國共產(chǎn)主義青年團(tuán)與中國國民黨青年團(tuán)在北京共同舉辦兩岸青年論壇，并發(fā)表四點共識。這是國共兩黨青年組織首次共同開展的交流活動，是兩黨交流領(lǐng)域的進(jìn)一步拓展。
12月16日 北京公布臺胞捐資建設(shè)奧運情況 北京市僑辦主任喬衛(wèi)表示，港澳臺僑同胞捐資建設(shè)的2008年北京奧運場館——國家游泳中心到位的捐贈資金目前已超6.5億元人民幣，其中來自臺灣的捐贈金額約6000萬人民幣。
12月22日 第三屆京臺環(huán)�？萍冀涣鲿� 由臺盟中央與北京市科學(xué)技術(shù)委員會共同舉辦的第三屆京臺環(huán)保科技交流會在北京舉行，來自臺灣環(huán)境工程技師工會的專家、學(xué)者、企業(yè)代表20余人，北京專家、企業(yè)代表60余人參會。(中新網(wǎng)整理)
